创建国内同类一流的检测机构，力争达到国内同类实验室的先进水平。确保检测工作的科学、公正、准确、有效，按照质量体系运作，切实为用户提供高质量的检测服务，为疾病控制、卫生监督提供科学的数据，以满足各个方面的需求。

本中心对质量体系制定总目标（中长期目标）是：3~5年内达到国家实验室认可，检验数据准确率达99％以上，检验报告及时率达99％。